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現階段，港澳通行證簽注是可以異地辦理的。
公民若為當地戶籍，可以帶上本人身份證原件和港澳通行證原件到當地出入境部門申請辦理個人簽注；若非當地戶籍，除提供上述材料外，還應提供本人在當地辦理有效的居住證原件到當地出入境部門申請辦理。
據《往來港澳通行證、簽注申請須知》要求內地居民申請往來港澳簽注，應填寫申請表，并提交下列材料：
1、有效往來港澳通行證（同時申請往來港澳通行證的除外）；
2、與申請事由相關的申請材料；
3、按照公安部有關規定在非常住戶口所在地申請往來港澳簽注的，還須提交符合在非常住戶口所在地申請條件的證明；
4、軍人、登記備案的國家工作人員，應當提交本人所屬單位或者上級主管單位按照人事管理權限審批后出具的同意辦理出入境證件的函；
5、未實行按需申領護照地區的內地居民，還須按照有關規定出具相關證明材料。 內地居民同時申請往來港澳通行證和簽注的,無須重復提交相關材料。
