柯南為什么會變小

在第一集中，新一為了追查黑衣人，沒想到被背后的同伙集中暈倒，被灌下APTX4869后變成柯南。

工藤新一因為目擊黑衣組織的交易被發現而遭毒手，被灌下APTX4869（組織研發的藥物）后導致身體縮小至7歲左右。新一擔心自己的事會危及周圍人的安全，而在阿笠博士的幫助下隱藏真實身份，化名江戶川柯南，寄住在與自己青梅竹馬的女友毛利蘭家中，轉學至帝丹小學一年B班，與吉田步美、圓谷光彥、小島元太成為朋友，四人組成了少年偵探團。

柯南后來住在小蘭家中，希望借助小蘭的父親毛利小五郎偵探的身份追查組織，可是小五郎卻是個“迷偵探”。柯南只得借助自己沒有減退的推理天份幫助小五郎破案，但因為身體變小導致辦案時不便，危險性也增加，因此阿笠博士為他發明了手表型麻醉槍和領結型變聲器等道具。