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軍校專業主要分為三類，分別為指揮類專業、非指揮類專業、合訓分流專業，指揮類專業是為各軍兵種培養軍事指揮管理人才，非指揮類專業培養為部隊、軍校培養專業技術人才，合訓分流是培養懂技術、會管理、能指揮的復合型初級指揮軍官。
一、指揮類專業
指揮類專業有明確的培養目標，主要是為各軍兵種培養軍事指揮管理人才。
二、非指揮類專業
專業技術院校以及綜合院校的非指揮類專業，擔負著為部隊、軍隊科研單位、軍校培養專業技術人才的任務。其畢業學員主要到部隊的各個專業技術崗位任職。
三、“合訓分流”專業
“合訓分流”的全稱是“學歷教育合訓、專業訓練分流”。這是1999年全軍院校編制體制調整后開始的新的初級指揮專業人才培養模式。“合訓分流”的培養目標是：培養懂技術、會管理、能指揮的復合型初級指揮軍官。
