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區別如下：
1、開花時間：令箭荷花與曇花的區別最明顯的是開花時間。曇花每年9月前后夜間開放，一般在晚上8—10時開，從開放至枯萎只有8小時左右；而令箭荷花每年4月前后，白天開放一朵花，從開放至枯萎1到2天。
2、花色不同： 令箭荷花與曇花的區別可以從花色上辨別。曇花花艷麗非凡，白色稍帶乳白色，筒部長于花瓣；而令箭荷花花色艷麗，大都是深紅、紫色，也有少數粉紅、黃色，筒部略短于花瓣。
3、莖枝不同：令箭荷花與曇花的花柄都是著生于扁枝邊緣凹。曇花的扁枝比較寬、簿、軟，邊緣是波浪式淺鋸齒狀；而令箭荷花的扁枝比較窄、厚、硬，邊緣是圓鋸齒狀。 4、特性不同：曇花耐濕，不耐寒，冬季應置于10攝氏度以上房間內，才能安全越冬；而令箭荷花耐寒，不耐濕，冬季在1攝氏度到8攝氏度，仍能安全越冬生長。
